Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EFNA1P20827 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms