Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms