Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms