Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIG1P18858 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIG1P18858 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIG1P18858 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LIG1P18858 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIG1P18858 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIG1P18858 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIG1P18858 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIG1P18858 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIG1P18858 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIG1P18858 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LIG1P18858 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIG1P18858 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIG1P18858 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIG1P18858 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIG1P18858 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIG1P18858 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIG1P18858 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIG1P18858 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIG1P18858 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIG1P18858 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIG1P18858 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIG1P18858 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIG1P18858 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIG1P18858 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LIG1P18858 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LIG1P18858 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIG1P18858 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LIG1P18858 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIG1P18858 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIG1P18858 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIG1P18858 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIG1P18858 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIG1P18858 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIG1P18858 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIG1P18858 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIG1P18858 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIG1P18858 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIG1P18858 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIG1P18858 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIG1P18858 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LIG1P18858 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LIG1P18858 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIG1P18858 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIG1P18858 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LIG1P18858 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LIG1P18858 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIG1P18858 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIG1P18858 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIG1P18858 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIG1P18858 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIG1P18858 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LIG1P18858 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LIG1P18858 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
LIG1P18858 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIG1P18858 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms