Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF4P18848 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF4P18848 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF4P18848 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF4P18848 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF4P18848 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF4P18848 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF4P18848 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF4P18848 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF4P18848 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF4P18848 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF4P18848 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF4P18848 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATF4P18848 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATF4P18848 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATF4P18848 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATF4P18848 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATF4P18848 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATF4P18848 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATF4P18848 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATF4P18848 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATF4P18848 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATF4P18848 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATF4P18848 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATF4P18848 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATF4P18848 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATF4P18848 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATF4P18848 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATF4P18848 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATF4P18848 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATF4P18848 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATF4P18848 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATF4P18848 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATF4P18848 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATF4P18848 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATF4P18848 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATF4P18848 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms