Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD46P15529 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD46P15529 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CD46P15529 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD46P15529 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD46P15529 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD46P15529 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD46P15529 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD46P15529 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD46P15529 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD46P15529 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD46P15529 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD46P15529 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD46P15529 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD46P15529 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD46P15529 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD46P15529 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD46P15529 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD46P15529 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD46P15529 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD46P15529 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD46P15529 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD46P15529 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD46P15529 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD46P15529 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD46P15529 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD46P15529 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD46P15529 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD46P15529 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD46P15529 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CD46P15529 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD46P15529 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD46P15529 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD46P15529 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CD46P15529 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD46P15529 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD46P15529 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD46P15529 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD46P15529 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD46P15529 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD46P15529 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CD46P15529 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD46P15529 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD46P15529 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD46P15529 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD46P15529 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD46P15529 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms