Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYL1P12980 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYL1P12980 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYL1P12980 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYL1P12980 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYL1P12980 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYL1P12980 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LYL1P12980 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYL1P12980 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYL1P12980 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYL1P12980 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYL1P12980 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYL1P12980 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYL1P12980 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYL1P12980 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYL1P12980 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYL1P12980 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYL1P12980 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYL1P12980 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYL1P12980 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYL1P12980 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYL1P12980 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYL1P12980 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYL1P12980 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYL1P12980 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYL1P12980 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYL1P12980 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYL1P12980 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYL1P12980 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYL1P12980 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYL1P12980 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYL1P12980 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYL1P12980 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms