Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1P11387 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1P11387 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1P11387 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1P11387 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1P11387 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1P11387 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1P11387 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1P11387 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1P11387 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1P11387 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1P11387 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1P11387 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1P11387 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1P11387 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1P11387 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1P11387 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1P11387 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1P11387 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1P11387 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1P11387 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1P11387 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1P11387 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1P11387 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1P11387 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1P11387 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1P11387 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1P11387 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1P11387 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1P11387 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1P11387 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1P11387 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1P11387 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1P11387 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1P11387 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1P11387 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1P11387 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1P11387 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1P11387 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1P11387 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1P11387 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1P11387 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1P11387 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1P11387 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1P11387 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1P11387 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1P11387 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1P11387 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1P11387 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1P11387 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1P11387 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1P11387 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1P11387 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1P11387 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1P11387 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1P11387 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1P11387 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1P11387 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1P11387 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1P11387 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1P11387 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1P11387 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1P11387 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1P11387 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1P11387 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1P11387 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1P11387 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1P11387 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1P11387 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1P11387 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1P11387 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1P11387 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1P11387 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1P11387 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1P11387 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1P11387 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1P11387 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOP1P11387 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOP1P11387 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOP1P11387 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOP1P11387 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOP1P11387 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOP1P11387 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOP1P11387 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1P11387 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1P11387 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1P11387 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1P11387 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1P11387 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1P11387 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1P11387 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1P11387 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1P11387 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1P11387 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1P11387 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1P11387 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1P11387 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1P11387 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1P11387 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1P11387 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms