Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLI3P10071 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLI3P10071 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLI3P10071 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLI3P10071 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLI3P10071 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI3P10071 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI3P10071 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI3P10071 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI3P10071 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI3P10071 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI3P10071 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI3P10071 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI3P10071 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI3P10071 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI3P10071 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI3P10071 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI3P10071 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI3P10071 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI3P10071 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI3P10071 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI3P10071 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLI3P10071 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GLI3P10071 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GLI3P10071 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GLI3P10071 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GLI3P10071 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GLI3P10071 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GLI3P10071 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GLI3P10071 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GLI3P10071 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GLI3P10071 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GLI3P10071 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GLI3P10071 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GLI3P10071 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GLI3P10071 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GLI3P10071 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GLI3P10071 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GLI3P10071 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GLI3P10071 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GLI3P10071 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLI3P10071 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLI3P10071 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLI3P10071 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLI3P10071 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLI3P10071 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLI3P10071 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLI3P10071 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLI3P10071 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GLI3P10071 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLI3P10071 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GLI3P10071 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLI3P10071 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLI3P10071 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLI3P10071 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLI3P10071 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLI3P10071 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLI3P10071 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLI3P10071 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GLI3P10071 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GLI3P10071 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLI3P10071 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLI3P10071 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLI3P10071 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLI3P10071 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLI3P10071 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLI3P10071 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLI3P10071 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLI3P10071 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLI3P10071 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLI3P10071 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLI3P10071 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLI3P10071 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLI3P10071 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLI3P10071 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLI3P10071 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLI3P10071 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLI3P10071 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLI3P10071 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLI3P10071 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI3P10071 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI3P10071 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI3P10071 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI3P10071 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI3P10071 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI3P10071 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI3P10071 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI3P10071 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI3P10071 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI3P10071 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI3P10071 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI3P10071 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI3P10071 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI3P10071 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI3P10071 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI3P10071 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI3P10071 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI3P10071 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLI3P10071 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI3P10071 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms