Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-13P0DP09 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms