Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB1P08034 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB1P08034 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB1P08034 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB1P08034 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB1P08034 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB1P08034 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB1P08034 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB1P08034 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB1P08034 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB1P08034 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB1P08034 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB1P08034 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB1P08034 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB1P08034 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB1P08034 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB1P08034 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB1P08034 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB1P08034 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB1P08034 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB1P08034 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB1P08034 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB1P08034 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB1P08034 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB1P08034 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB1P08034 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB1P08034 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB1P08034 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB1P08034 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB1P08034 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB1P08034 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB1P08034 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB1P08034 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJB1P08034 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJB1P08034 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJB1P08034 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB1P08034 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB1P08034 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB1P08034 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB1P08034 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB1P08034 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB1P08034 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB1P08034 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB1P08034 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB1P08034 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB1P08034 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB1P08034 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB1P08034 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB1P08034 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB1P08034 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB1P08034 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB1P08034 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB1P08034 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB1P08034 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB1P08034 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB1P08034 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB1P08034 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB1P08034 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB1P08034 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB1P08034 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB1P08034 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB1P08034 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB1P08034 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB1P08034 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB1P08034 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB1P08034 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB1P08034 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB1P08034 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB1P08034 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB1P08034 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB1P08034 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB1P08034 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB1P08034 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB1P08034 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB1P08034 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB1P08034 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB1P08034 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms