Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms