Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4AP04350 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4AP04350 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4AP04350 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4AP04350 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4AP04350 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4AP04350 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4AP04350 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4AP04350 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4AP04350 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4AP04350 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4AP04350 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4AP04350 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4AP04350 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4AP04350 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4AP04350 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4AP04350 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4AP04350 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4AP04350 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB4AP04350 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB4AP04350 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB4AP04350 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB4AP04350 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB4AP04350 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB4AP04350 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB4AP04350 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB4AP04350 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB4AP04350 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB4AP04350 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB4AP04350 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB4AP04350 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4AP04350 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4AP04350 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4AP04350 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4AP04350 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4AP04350 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4AP04350 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4AP04350 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4AP04350 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4AP04350 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4AP04350 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4AP04350 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4AP04350 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4AP04350 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4AP04350 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4AP04350 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4AP04350 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4AP04350 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4AP04350 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4AP04350 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4AP04350 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4AP04350 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4AP04350 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4AP04350 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4AP04350 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4AP04350 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4AP04350 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4AP04350 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4AP04350 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4AP04350 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4AP04350 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4AP04350 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4AP04350 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4AP04350 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4AP04350 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBB4AP04350 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBB4AP04350 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBB4AP04350 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBB4AP04350 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB4AP04350 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB4AP04350 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB4AP04350 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB4AP04350 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms