Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms