Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPBO95292 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPBO95292 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPBO95292 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPBO95292 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPBO95292 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPBO95292 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPBO95292 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPBO95292 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPBO95292 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAPBO95292 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAPBO95292 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAPBO95292 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPBO95292 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPBO95292 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPBO95292 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPBO95292 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPBO95292 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPBO95292 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPBO95292 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPBO95292 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPBO95292 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPBO95292 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPBO95292 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPBO95292 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPBO95292 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPBO95292 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPBO95292 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAPBO95292 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPBO95292 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPBO95292 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPBO95292 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPBO95292 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPBO95292 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPBO95292 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPBO95292 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPBO95292 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPBO95292 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPBO95292 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPBO95292 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPBO95292 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPBO95292 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPBO95292 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPBO95292 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAPBO95292 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAPBO95292 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAPBO95292 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAPBO95292 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAPBO95292 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAPBO95292 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAPBO95292 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAPBO95292 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAPBO95292 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAPBO95292 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAPBO95292 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms