Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG12O94817 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG12O94817 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG12O94817 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms