Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LANCL1O43813 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LANCL1O43813 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms