Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 SERGEF-212ENST00000529728 1396 ntTSL 519.58■□□□□ 0.737e-7■■■■□ 22.6
RBFOX2O43251 SERGEF-214ENST00000530925 793 ntTSL 317.53■□□□□ 0.47e-7■■■■□ 22.6
RBFOX2O43251 SERGEF-213ENST00000530613 893 ntTSL 516.6■□□□□ 0.257e-7■■■■□ 22.6
RBFOX2O43251 SERGEF-218ENST00000532212 622 ntTSL 316.48■□□□□ 0.237e-7■■■■□ 22.6
RBFOX2O43251 SERGEF-223ENST00000533328 541 ntTSL 516.48■□□□□ 0.237e-7■■■■□ 22.6
RBFOX2O43251 SERGEF-220ENST00000532389 833 ntTSL 516■□□□□ 0.157e-7■■■■□ 22.6
RBFOX2O43251 SERGEF-203ENST00000524716 548 ntTSL 48.02□□□□□ -1.137e-7■■■■□ 22.6
RBFOX2O43251 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.497e-7■■■■□ 22.6
RBFOX2O43251 TNFRSF1A-205ENST00000534885 2069 ntTSL 1 (best)16.52■□□□□ 0.242e-7■■■■□ 22.6
RBFOX2O43251 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.162e-7■■■■□ 22.6
RBFOX2O43251 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.022e-7■■■■□ 22.6
RBFOX2O43251 TNFRSF1A-212ENST00000539372 1063 ntTSL 214.48□□□□□ -0.092e-7■■■■□ 22.6
RBFOX2O43251 TNFRSF1A-204ENST00000440083 1034 ntTSL 211.83□□□□□ -0.522e-7■■■■□ 22.6
RBFOX2O43251 TNFRSF1A-216ENST00000543995 1531 ntTSL 511.5□□□□□ -0.572e-7■■■■□ 22.6
RBFOX2O43251 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.752e-7■■■■□ 22.6
RBFOX2O43251 TNFRSF1A-207ENST00000535958 568 ntTSL 49.62□□□□□ -0.872e-7■■■■□ 22.6
RBFOX2O43251 TNFRSF1A-208ENST00000536194 581 ntTSL 38.86□□□□□ -0.992e-7■■■■□ 22.6
RBFOX2O43251 TNFRSF1A-211ENST00000538363 554 ntTSL 28.63□□□□□ -1.032e-7■■■■□ 22.6
RBFOX2O43251 TNFRSF1A-214ENST00000543048 571 ntTSL 57.5□□□□□ -1.212e-7■■■■□ 22.6
RBFOX2O43251 AGAP3-225ENST00000498559 581 ntTSL 213.66□□□□□ -0.221e-6■■■■□ 22.6
RBFOX2O43251 AGAP3-213ENST00000475145 413 ntTSL 29.03□□□□□ -0.961e-6■■■■□ 22.6
RBFOX2O43251 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.022e-11■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.332e-11■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 NCOA6-201ENST00000359003 7081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.922e-11■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 SLC5A6-215ENST00000476319 842 ntTSL 311.72□□□□□ -0.531e-9■■■■□ 22.5
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RBFOX2O43251 SLC5A6-216ENST00000481751 615 ntTSL 29.37□□□□□ -0.911e-9■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 SLC5A6-212ENST00000461319 598 ntTSL 37.9□□□□□ -1.141e-9■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 MLF1-215ENST00000498592 707 ntTSL 314.73□□□□□ -0.051e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.331e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.41e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.451e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.471e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 MLF1-212ENST00000491767 787 ntTSL 1 (best)12.08□□□□□ -0.481e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.481e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 MLF1-209ENST00000482628 1050 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.761e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 MLF1-202ENST00000359117 2222 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.021e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 MLF1-214ENST00000497004 3048 ntTSL 1 (best)6.91□□□□□ -1.31e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 MLF1-213ENST00000495452 742 ntTSL 35.56□□□□□ -1.521e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 MLF1-207ENST00000477042 750 ntTSL 55.52□□□□□ -1.531e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.741e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.921e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 MLF1-204ENST00000466246 653 ntTSL 21.52□□□□□ -2.171e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 MLF1-211ENST00000487838 473 ntTSL 21.23□□□□□ -2.211e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 SEPT6-206ENST00000460411 1393 ntTSL 216.93■□□□□ 0.36e-16■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.166e-16■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.186e-16■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.446e-16■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.556e-16■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 SEPT6-205ENST00000394610 4694 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.816e-16■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 SEPT6-203ENST00000354416 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.26e-16■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 SEPT6-207ENST00000467310 1061 ntTSL 37.21□□□□□ -1.266e-16■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 SLC38A3-201ENST00000417121 491 ntTSL 513.67□□□□□ -0.226e-11■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 SLC38A3-206ENST00000614032 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.946e-11■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 SLC38A3-202ENST00000417851 438 ntTSL 39.08□□□□□ -0.966e-11■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 SLC38A3-204ENST00000445096 880 ntTSL 57.93□□□□□ -1.146e-11■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.996e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.596e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 BTBD19-207ENST00000485668 2659 ntTSL 218.18■□□□□ 0.56e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 ADAM15-214ENST00000468053 367 ntTSL 56.89□□□□□ -1.318e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 ALDH1A2-224ENST00000561070 554 ntTSL 47.37□□□□□ -1.231e-6■■■■□ 22.5
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RBFOX2O43251 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.375e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.695e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.35e-7■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 RNF207-201ENST00000377939 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.822e-7■■■■□ 22.5
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RBFOX2O43251 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.732e-6■■■■□ 22.5
RBFOX2O43251 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.271e-6■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.49e-7■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.179e-7■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.259e-7■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 MED15-210ENST00000432052 598 ntTSL 416.58■□□□□ 0.244e-8■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 MED15-225ENST00000477824 571 ntTSL 516.13■□□□□ 0.174e-8■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 MED15-215ENST00000444094 551 ntTSL 415.41■□□□□ 0.064e-8■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 MED15-227ENST00000486656 577 ntTSL 414.45□□□□□ -0.14e-8■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 MED15-205ENST00000414658 717 ntTSL 314.45□□□□□ -0.14e-8■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 MED15-214ENST00000441501 840 ntTSL 313.17□□□□□ -0.34e-8■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.374e-8■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 MED15-217ENST00000445987 590 ntTSL 412.31□□□□□ -0.444e-8■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 MED15-211ENST00000433831 3267 ntTSL 512.03□□□□□ -0.484e-8■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.514e-8■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.564e-8■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.684e-8■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 UBAC1-204ENST00000478485 773 ntTSL 218.69■□□□□ 0.582e-12■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 TYK2-204ENST00000525220 583 ntTSL 413.63□□□□□ -0.232e-7■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.512e-7■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.723e-6■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.663e-6■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 FKBP2-204ENST00000535135 639 ntTSL 319.06■□□□□ 0.643e-6■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.513e-6■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.283e-6■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.273e-6■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 STK32C-203ENST00000368620 830 ntTSL 316.65■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.253e-6■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.26e-7■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 ARFGEF1-206ENST00000519436 571 ntTSL 316.18■□□□□ 0.183e-6■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 BNIP3-204ENST00000633835 1062 ntTSL 315.94■□□□□ 0.144e-8■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.083e-6■■■■□ 22.4
RBFOX2O43251 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.023e-6■■■■□ 22.4
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