Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms