Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms