Protein–RNA interactions for Protein: O15066

KIF3B, Kinesin-like protein KIF3B, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3BO15066 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KIF3BO15066 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms