Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3C2AO00443 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3C2AO00443 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms