Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms