Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00587B1AMM8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms