Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms