Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCNX2A6NKB5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCNX2A6NKB5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms