Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMX3A6NHT5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms