Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf170A2RU37 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms