Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD3A2A2Y4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms