Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRI6

CENPVL3, Centromere protein V-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL3A0A0U1RRI6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPVL3A0A0U1RRI6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms