Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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