Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 OR11G2-202ENST00000641682 3786 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 ASAH1-203ENST00000381733 2512 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 SIPA1L1-203ENST00000537413 4129 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AC116631.1-202ENST00000640984 683 ntBASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AC124045.1-201ENST00000606008 1953 ntBASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 CREM-208ENST00000361599 2170 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 C11orf54-202ENST00000354421 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
COG3Q96JB2 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms