Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL354733.2-202ENST00000615485 742 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.123-201ENST00000616695 286 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.99-201ENST00000621370 254 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC018558.4-201ENST00000622153 281 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC130456.6-201ENST00000623745 765 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 NR1I3-235ENST00000628566 1201 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC022167.5-202ENST00000637237 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 OR8H1-203ENST00000641600 2927 ntAPPRIS P2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 TEKT1-201ENST00000338694 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC116366.1-201ENST00000443093 3730 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CDY1-202ENST00000361963 2177 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CCDC63-204ENST00000552694 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PAGE4-201ENST00000218068 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ORM1-201ENST00000259396 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PGAM1P3-201ENST00000420790 565 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL121908.1-201ENST00000443055 668 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LINC00460-203ENST00000444865 739 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL139135.2-201ENST00000445040 433 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ENTPD1-AS1-206ENST00000449197 523 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL590004.3-201ENST00000450255 443 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL356311.1-201ENST00000451697 258 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LINC00489-201ENST00000457816 543 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 SYNPR-208ENST00000472899 527 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RN7SL89P-201ENST00000480252 283 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RN7SL335P-201ENST00000482790 304 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC127024.1-201ENST00000490847 418 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RN7SL124P-201ENST00000498656 285 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC008629.3-201ENST00000505786 586 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC122710.2-201ENST00000506093 596 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 SCARNA20.1-201ENST00000516009 138 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC084026.2-201ENST00000521101 642 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 BTF3P1-201ENST00000522014 495 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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PDCD1Q15116 OVCH1-AS1-201ENST00000549411 743 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PTCSC3-201ENST00000556013 571 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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PDCD1Q15116 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL137190.1-201ENST00000603288 282 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LINC00635-221ENST00000609366 784 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 5S_rRNA.20-201ENST00000612104 118 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 OR4F15-201ENST00000332238 2119 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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