Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC104123.1-202ENST00000511775 581 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RN7SKP105-201ENST00000517192 314 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC01288-201ENST00000519189 529 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC003991.2-201ENST00000520993 576 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MRPS28-207ENST00000521434 585 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ZNF345-205ENST00000526123 458 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 KCTD21-AS1-204ENST00000528468 554 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 OR2AL1P-201ENST00000529862 507 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 TMEM106C-219ENST00000552546 742 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 TIMM9-205ENST00000555404 430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL358332.1-201ENST00000555649 813 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 SLC25A6P5-202ENST00000602729 1038 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL021808.1-201ENST00000604325 1117 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 TTR-204ENST00000610404 1040 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 TTR-205ENST00000613781 556 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 BX005195.1-201ENST00000618097 1198 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 COPS3-203ENST00000439936 1394 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CCR3-208ENST00000545097 1786 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC015969.1-201ENST00000366218 1416 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 SMCP-201ENST00000368765 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 TRAV17-201ENST00000390445 484 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MAML3-201ENST00000398940 831 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC127537.1-201ENST00000418183 748 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL358942.1-201ENST00000418595 1178 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 OR4A8-201ENST00000418689 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RBMY2FP-202ENST00000420346 1263 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL162595.2-201ENST00000430677 792 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL035420.1-201ENST00000430679 458 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC025262.1-201ENST00000434563 589 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC239798.1-201ENST00000449024 1176 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL356310.1-201ENST00000452024 585 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 NDUFB11P1-201ENST00000455818 465 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 DNAJC9-AS1-203ENST00000457758 548 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RN7SL65P-201ENST00000485221 315 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RN7SL28P-201ENST00000488836 298 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ABHD10-204ENST00000494817 801 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC136424.1-201ENST00000518425 542 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC027541.1-201ENST00000519306 485 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC091820.1-201ENST00000523497 648 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC107959.3-202ENST00000523806 450 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC064807.3-201ENST00000523810 470 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms