Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL136452.1-201ENST00000448495 439 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 GAPDHP28-201ENST00000455134 1003 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC9-AS1-203ENST00000457758 548 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC068134.3-201ENST00000513620 788 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC091147.1-201ENST00000583290 510 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL139220.2-217ENST00000609027 940 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC080112.3-201ENST00000612552 880 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 LINC01002-219ENST00000632747 621 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC079602.4-201ENST00000637836 532 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC087885.1-201ENST00000641910 848 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 NUCB2-208ENST00000529010 2274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC036108.4-201ENST00000611654 2516 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 SLC9B1P3-201ENST00000452667 1334 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 STXBP6-207ENST00000550887 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 PARP1P1-201ENST00000413631 3026 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ZNF438-203ENST00000375311 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 GTF2H2-201ENST00000274400 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 LINC01725-205ENST00000457273 1991 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 POLR1B-204ENST00000417433 3836 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 EFHC1-233ENST00000637353 3829 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 TNFSF15-201ENST00000374044 2789 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 NF1P2-201ENST00000556855 2505 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 HIPK1-208ENST00000426820 4112 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 GJB7-203ENST00000525899 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 FHL1-217ENST00000539015 2310 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF19-204ENST00000403372 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL358913.2-201ENST00000553881 1548 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MT-TS1-201ENST00000387416 69 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 IGHV2-5-201ENST00000390597 378 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 LINC00316-201ENST00000416722 455 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P7-201ENST00000428803 703 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 LINC01007-203ENST00000451953 579 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 LINC01053-201ENST00000457628 771 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 C1orf112-208ENST00000496973 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC090835.1-201ENST00000515189 1024 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 SNRPCP14-201ENST00000524498 205 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC090159.1-201ENST00000525309 806 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 OR4A9P-201ENST00000526326 944 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A10-203ENST00000526800 699 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AP000879.2-201ENST00000530525 497 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 TMEM269-202ENST00000536543 983 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AEBP2-207ENST00000541908 975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 TMEM106C-212ENST00000549288 321 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL355922.4-201ENST00000555642 449 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC023905.1-203ENST00000560180 765 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ADGRF5P1-202ENST00000590130 980 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC106782.6-201ENST00000611264 512 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AQP4-208ENST00000622234 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms