Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 AC122688.2-201ENST00000543922 585 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 LHX9-203ENST00000367390 7413 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 ZNF185-212ENST00000539731 4334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 WDR11-201ENST00000263461 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 CCDC149-204ENST00000504487 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 NBPF15-206ENST00000581897 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 INSR-202ENST00000341500 8954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 CRNKL1-201ENST00000377327 4370 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 CHN2-208ENST00000412711 2991 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 CSNK1G1-201ENST00000303052 8179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 ARHGEF9-234ENST00000637557 4775 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 AC107398.3-201ENST00000562284 7000 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
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PTPRMP28827 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
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PTPRMP28827 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
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PTPRMP28827 TMSB15B-208ENST00000620307 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 HRH1-201ENST00000397056 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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PTPRMP28827 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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PTPRMP28827 POGZ-201ENST00000271715 6626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 MR1-208ENST00000614012 7860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 ATP8A2-204ENST00000381655 9575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 ADGRE2-201ENST00000315576 6767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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PTPRMP28827 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 CFAP61-203ENST00000377293 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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PTPRMP28827 AC026367.2-201ENST00000610630 553 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 AC124045.1-201ENST00000606008 1953 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 Z82209.2-201ENST00000623410 2012 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 PDPR-201ENST00000288050 9255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 XRCC6P5-201ENST00000435236 1795 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 MLIP-201ENST00000274897 1815 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PTPRMP28827 AL031594.1-201ENST00000417123 1932 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 GPR63-201ENST00000229955 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
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