Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 MEF2A-203ENST00000449277 5182 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 DLG2-202ENST00000330014 2789 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 IGHV4-59-201ENST00000390629 495 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 CNN3P1-201ENST00000401596 935 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC027319.1-201ENST00000591657 511 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 CDH18-203ENST00000502796 2386 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ERVFRD-1-202ENST00000542862 3184 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ASAH1-227ENST00000636455 1777 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC091132.4-201ENST00000587960 2262 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC000099.1-202ENST00000413812 1912 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 SLC9A6-214ENST00000637581 4872 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 PPP2R5C-218ENST00000556260 2013 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC012560.1-203ENST00000510550 595 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 MAPK10-272ENST00000641110 2724 ntAPPRIS P2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ARMC3-203ENST00000409049 2479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 TCF12-206ENST00000543579 1809 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC027097.2-201ENST00000588925 1976 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC107884.1-207ENST00000504206 4433 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 C8orf37-201ENST00000286688 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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