Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 CACNB2-213ENST00000612134 3825 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 ARHGEF9-202ENST00000374870 4644 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 TFRC-201ENST00000360110 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 MASP1-205ENST00000392472 3900 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SPATA31E2P-201ENST00000554414 4965 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC110079.1-201ENST00000567913 4395 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SERPINA15P-201ENST00000529287 266 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 OR7A1P-201ENST00000601206 970 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 MYH1-201ENST00000226207 6024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC011632.1-202ENST00000518128 2810 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 BBS12-203ENST00000542236 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 EPB41L1-205ENST00000373946 6327 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 TMEM99-204ENST00000622451 2073 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 ZEB2-245ENST00000638087 9339 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SHPRH-201ENST00000275233 6649 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 ALG13-201ENST00000251943 3997 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PLA2G4E-201ENST00000399518 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CACNA1C-201ENST00000327702 6616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 METTL14-201ENST00000388822 6669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 DDX46-202ENST00000452510 5689 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PPP1R3B-201ENST00000310455 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TIAM2-202ENST00000318981 5916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL139806.1-201ENST00000403057 1002 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL390856.1-201ENST00000412174 628 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PIGN-225ENST00000638435 4382 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 UGT2B7-205ENST00000622664 1532 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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