Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 OXCT1-204ENST00000509987 1441 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 MTRF1-203ENST00000379480 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 PRAC1-201ENST00000290294 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 OR5E1P-201ENST00000305754 927 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 FCAR-204ENST00000359272 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 SNORA55-201ENST00000364587 135 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 FABP9-201ENST00000379071 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 RN7SKP89-201ENST00000410774 242 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC069213.1-202ENST00000417011 810 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AL353611.1-201ENST00000417054 462 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 MIR4500HG-204ENST00000453832 827 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 OR7A1P-201ENST00000601206 970 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AL353608.4-201ENST00000624487 1188 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 SLC9B1P3-201ENST00000452667 1334 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 LEKR1-204ENST00000470811 2881 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AL357153.1-201ENST00000500016 2941 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC093844.1-201ENST00000514910 1361 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 NPM1P14-201ENST00000343743 866 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 ALDH1A1-202ENST00000376939 822 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 OR4F7P-201ENST00000402444 931 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 OR4F1P-201ENST00000405102 938 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AL359475.1-201ENST00000414505 292 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 OR4F2P-201ENST00000424047 938 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC130472.1-201ENST00000427885 309 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AL161646.1-201ENST00000447860 1013 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 RN7SL508P-201ENST00000464472 303 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 RN7SL519P-201ENST00000497925 288 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC023794.3-204ENST00000510754 236 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 LINC02223-203ENST00000514771 781 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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