Protein–RNA interactions for Protein: S4R3F8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3F8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
S4R3F8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
S4R3F8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
S4R3F8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
S4R3F8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
S4R3F8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
S4R3F8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
S4R3F8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms