Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYVE1Q9Y5Y7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms