Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAXBP1Q9Y5B6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms