Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1DQ9Y2S0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1DQ9Y2S0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms