Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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