Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PNMA8BQ9ULN7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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