Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJD2Q9UKL4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms