Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX20Q9UHI6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms