Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL13Q9P2N7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL13Q9P2N7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms