Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNQ9P2M7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGNQ9P2M7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGNQ9P2M7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CGNQ9P2M7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms