Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms